Доход, получаемый в результате деятельности судов, зарегистрированных на Кипре или по дивидендам, получаемым судовладельцами, чьи суда зарегистрированы под кипрским флагом и осуществляющими деятельность в международных водах, налог не взымается.
Налогообложению не подлежит заработная плата, получаемая капитаном, офицерами и экипажем кипрского судна.
Местные компании/частные предприниматели или КМБ, занимающиеся управлением деятельности судов и контроль за деятельностью экипажей из расположенного на Кипре офиса, начиная с 31 декабря 2000 г., обладают правом выбора между налогообложением за фискальный год по ставке 4.25% или же по ставке 25% от ставок, применяемых к налогу на тоннаж иностранных судов, зарегистрированных вне территории Кипра. Данный специальный режим налогообложения судовладельческих и судоходных компаний применяется вплоть до 2020 г.